Sofrendo de ataques frequentes de asma, a jovem Anna Sasaki é quieta, não sociável, e isolada de seus pares, causando preocupação sem fim ao seu guardião. Por recomendação do médico, Anna é enviada para o interior, esperançosamente o ar mais limpo e um estilo de vida mais relaxante melhorará sua saúde e a ajudará a limpar sua mente. Envolvida em sua paixão por esboço, Anna passa seus dias de verão vivendo com sua tia e tio em uma pequena cidade perto do mar. Um dia enquanto vagava fora, Anna descobre uma mansão abandonada conhecida como a Casa de Marsh. Porém, ela logo descobre que a residência não é tão vaga quanto parece, correndo para uma rapariga misteriosa chamada Marnie. A disposição efervescente de Marnie lentamente começa a trazer Anna para fora de sua casca conforme ela retorna noite após noite para encontrar-se com sua nova amiga. Mas parece haver mais para a rapariga estranha do que o que se vê—conforme seu tempo na cidade chega ao fim, Anna começa a descobrir a verdade por trás das paredes da Casa de Marsh. Omoide no Marnie conta a história tocante da jornada de auto-descoberta de uma jovem rapariga e amizade, e o verão que ela se lembrará pelo resto de sua vida.
