Em um tempo quando magia está em declínio em meio à sociedade, Atsuko Kagari é uma menina alegre que entra Luna Nova Academy para realizar seu sonho de se tornar uma bruxa como seu ídolo, Shiny Chariot. Shiny é uma bruxa famosa que desapareceu de vista pública muitos anos atrás. A caminho da escola, Kagari conhece o gentil Lotte Yanson e o mischevious Sucy Manbavaran e os três se tornam amigos conforme compartilham um quarto no campus. Na academia, Atsuko logo descobre ela está em desvantagem séria comparada às outras meninas já que ela não vem de uma família mágica e é requerida para aprender o currículo mágico do zero. Tendo encontrado um item que uma vez pertenceu a Chariot, Atsuko deve descobrir como ativar e propriamente usar a misteriosa Shiny Rod conforme ela espera que possa levar a descobrir o que verdadeiramente aconteceu com seu ídolo desaparecido.
