Tsuki wa Higashi ni Hi wa Nishi ni: Operation Sanctuary

Naoki Kuzumi, um aluno do terceiro ano do ensino médio, perdeu seus pais em um acidente há cinco anos atrás, e está vivendo com sua tia, tio e prima Matsuri. Ele sempre pensou que sua vida era ordinária, além do fato de que ele não consegue lembrar do que aconteceu em sua juventude. Em um dia ensolarado enquanto tira uma soneca em um banco, uma garota ruiva -- Mikoto -- literalmente cai sobre ele do céu. Por alguma razão, ela pensa que ele é seu irmão mais novo. O período de tempo de Naoki é um abrigo temporal para aqueles do futuro, quando muitos estão sofrendo de uma doença incurável. Quando ela ouviu que seu irmão mais novo Yuusuke havia sido levado para a época de Naoki, Mikoto mesmo voltou no tempo.